对于这次的人口统计，朱载坖也做了改变，之前是由户部和地方州县衙门正印负责此事，朱载坖认为户部的职权已经是十分沉重了，根本无法完成这么繁杂的任务，而且户部没有惩罚职能，对于人口统计中发生的舞弊和漏报行为无法及时惩罚，而且朱载坖也并不认为户籍是应该有户部来管理的。
朱载坖认为是应该将户籍的管理从户部转移到刑部来了，朱载坖和随行的重臣们商量之后，决定制定大明户籍则例，规定各级巡检司为户籍管理的基层机构，州县正印和县尉、推官负责此事，在一省，以按察使和分管巡检司的按察副使为主管官员，直至刑部和刑部下设的提督巡检司衙门，作为管理户籍的最高机关。
这次隆庆户帖的制作和洪武户帖有异曲同工之妙，和洪武年间不同的是，这次户帖是由刑部制作的，上面盖的是刑部的大印，由里、乡、都、县一级一级统计上报之后直至刑部提督巡检司衙门。
除此之外，对于漏报、瞒报和不实的填报的，要层层追究责任，各级官员都要为此承担责任，同时无论是新生还是死亡，百姓都要到巡检司及时汇报，对于没有户帖的，抓住就充军，朝廷每五年进行一次普查，对于天下州县的人口增减予以掌握。
对于无缘无故减少人口的州县，不仅正印要为此承担责任，而且即便是在此期间已经升迁的官员，也要一律追责，巡检司不仅负责户帖的登基，也要负责户帖的查实工作，对于辖区内的户口，巡检司和州县衙门都要负责清理，还有就是地主蓄奴的问题，也是巡检司的责任。
朱载坖下达诏书，若是在辖区发现地主蓄奴二十人以上而巡检司没有发现的话，不仅蓄奴的地主抄没家产，流放哈密、大宁都司等处，巡检司全体官吏也全部流放缅甸。
对于这次的人口统计，朱载坖是很重视，在下达豁贱为良的诏书之后，朱载坖就立即召见了殷士儋、海瑞等人，要求浙直要严格统计人口，告知百姓，不登记户帖的后果，同时对于巡检司的登基，要予以检查，不仅是巡按御史、按察司，朱载坖也会命令锦衣亲军和东厂密查有没有漏报的情况，对于不如实申报户帖的，要予以严惩。
除了刑部掌握户帖之外，户部也要做好黄册的修订工作，使的黄册、户帖互相吻合，人口和应当征税的财产没有错漏，严防再次出现花分、诡寄等情况的发生。